电针和手法运针是两种不同性质的刺激，电针是依赖电流的作用来兴奋穴位组织，而手法运针则是借助提插捻转等机械动作达到刺激穴位组织的目的。

实验证明，电针与手法运针的针感与传入神经纤维类别不同，前者以麻为主，主要经以Ⅱ类为主的粗纤维传入中枢，手法运针以酸胀感为主，主要经以Ⅲ类为主的细纤维传入中枢。电针和手法运针的针刺效应也不尽相同。

例如给家兔膀胱内充以等渗温氯化钠溶液50ml，大多可使膀胱呈平静状态，部分出现小的节律性波动。用2~4次/s、幅度360°的手法捻针刺激次 穴经2~3s的潜伏期，则可见膀胱内压升高，每次运针15s可使膀胱内压升高0.392~0.980kPa，针500次有效率达90%以上;用同法针刺穴旁1厘米的对照点，不能使膀胱内压升高、针200次升高率仅为1%，且上升幅度不超过0.196kPa，具有显著的穴位特异性。而且适宜的电针刺激同一穴位则一般不能使膀胱内压升高，只有当刺激强度增加达血压升高、瞳孔放大时才能使膀胱内压升高，但经1~2次电针后针效减弱或消失，要加大刺激方可继续使膀胱内压改变，而且对照点及其他穴位也有同样的效应，无明显的穴位特异性，这种现象显然是痛刺激造成的应急反应。

因此就针刺次穴提高膀胱内压而言，手法运针的效果要较电针明显的多。实验证明，手法运针在提高皮肤温度、镇痛针麻、调整胃电、促进淋巴细胞转化、抑制痫样放电、降低癫痫状态下升高的皮层Ach和K+活度、提高痫症状态下降低的Na+活度等方面也均较电针为佳，而电针对促进网状内皮系统吞噬功能和对与前阿皮素有关的多肽的影响方面则较手法运针为好。因此，电针和手法运针应根据具体情况，分别采用。