1）水系统的竖向分区，根据风机盘管及管道的承压能力确定，使各环路水量分配均匀，若压差相差大，应在环路设置平衡阀。
2）为了防止盘管阻塞，应在风机盘管的供水管上，装设水过滤器，目前一般常用Y型水过滤器。
3）进出水管应装橡胶软接头，支吊架采用避振措施，防止机组运行时振动及噪声，影响其正常运行。
4）为便于对风机盘管的检修，初调水力平衡应在机组的供、回水管上安装调节阀门。
5）风机盘管冷凝水管的坡度。一般不宜小于0.01。
6）风机盘管冷水供回温度一般取7～12℃，热水供回温度一般取50～60℃，在可能的情况下，可提高供回水温差，其循环水质宜采用水处理后的洁净水。
7）风机盘管水系统的水平管段和盘管最高点，应设排气阀（目前生产的盘管在最高点有手动排气阀），最低点应设排污泄水装置。
8）风机盘管水系统一般为闭式循环，膨胀水箱应接在水泵回水管上。
