微生物絮凝剂的产生受其培养条件的影响，影响因素包括:

(1)培养基组成，包括碳源、氮源及生命所需的各种无机盐等。

不同的微生物需要不同的营养基质，如细菌中的自氧菌不能利用有机化合物，而异氧菌则需要有机化合物作为碳源(蔗糖、淀粉等)和氮源(牛肉膏、蛋白陈等)，产荚膜细菌需要较高浓度的糖类作为培养基。

(2)培养基初始pH值，pH值可影响絮凝剂产生菌的生长及絮凝物的分泌，一般来说，细菌的最适pH为中性到弱碱性，而霉菌为酸性。如MBFAg培养基的最佳初始pH为8-9，NOC-1的为8.5。

(3)培养温度，不同种类的微生物有不同的适宜温度范围，一般认为，最适宜的温度为25-35℃之间。

(4)培养时间，不同种类的微生物有不同的生长周期，因而产生絮凝剂的周期也不一样。

(5)通气情况(水浴摇床的速度)，直接影响絮凝剂产生菌的生长及絮凝剂的分泌。

微生物絮凝剂的絮凝能力除受上述培养条件的影响外，同样也受它所处理的水质条件的影响，如水质的pH值、浓度等，即有其特定的应用条件。