中国水仙的主要有两种品系：

(1)单瓣型

福建漳州特产，花冠色青白，花萼黄色，花被6瓣，中间有金色的副冠，形如盏状，花味清香，所以叫“金盏玉台”亦名"酒杯水仙"，花期约半个月；若副冠呈白色，花多，叶稍细者，则称"银盏玉台"。

(2)重瓣型（复瓣型）

花重瓣，白色，花被12瓣，卷成一簇，花冠下端轻黄而上端淡白，没有明显的副冠，名为“百叶水仙”或称“玉玲珑”，花期在二十天左右。花形不如单瓣的美，香气亦较差，是水仙的变种。

另外还根据产地分为漳州水仙和崇明水仙。通常所说的水仙常指漳州水仙，有着“漳州三宝”之称。漳州水仙又以园山麓种植的为最优，漳州早晨的太阳正好照在山脚下的花田上，下午的斜阳被圆山挡住了射线，向阳、遮阴兼而有之，是个冬暖夏凉的天然屏障。山下，九龙江支流和山谷泉涧纵横交织，水源充足；花田土壤松软，系砂质壤土；加上地质有温泉经过，即使天寒地冻的季节，也能保持适宜的地温。水仙花就是生长在这样优越的环境下，因而品性十分优异。