均相膜的电化学性能较为优良，但力学性能较差，常需其他纤维来增强。非均相膜的电化学性能比均相膜差，而力学性能较优，由于疏水性的高分子成膜材料和亲水性的离子交换树脂之间粘结力弱，常存在缝隙而影响离子选择透过性。

离子交换膜的膜电阻和选择透过性是膜的电化学性能的重要指标。阳离子在阳膜中透过性次序为：

Li＞Na＞NH4＞K＞Rb＞Cs＞Ag＞

Tl＞UO卂＞Mg＞Zn＞Co＞Cd＞

Ni＞Ca＞Sr＞Pb＞Ba

阴离子在阴膜中透过性次序为： F＞CH3COO＞HCOO＞Cl＞SCN＞Br＞

CrO娸＞NO婣＞I＞(COO)卆(草酸根)＞SO娸

膜电阻是与离子在膜中的淌度有关的一个数值，根据不同测定和计算方法可分成体积电阻和表面电阻。

水在膜中的渗透率就是离子在透过膜时带过去的水量。实用上水渗透率是膜的一个性能，其值愈大，在电渗析时水损失愈大，通常疏水性高分子材料膜中水渗透率远低于亲水性高分子材料膜。