有机膜净水器在使用过程中存在以下问题
（1）滤芯的更换成为净水器发展的瓶颈。
大多数膜分离水机，都采用有机膜作为粗滤和精滤。因国内的水质很容易污染有机膜，这就需要消费者经常更换滤芯，造成使用不方便。
（2）浪费水大、耗电、不方便。
采用RO膜过滤水，精密度较高。但存在浪费水很大，且需要耗电。给消费者无形中增加了使用成本，导致该产品看着好，用起来不好的现象。
（3）功能水宣传过大，消费者无法分辨。
大多数厂家都夸大其制水是健康水、小分子水、碱性水等宣传。却没有真正的技术来实现以上功能，或没有权威的检测机构证实这些功能的健康性。所以给消费者带来较多疑惑
