云南丁香是一种灌木植物，灌木，通常高2-5米。枝直立，灰褐色，无毛，具皮孔，小枝红褐色，圆柱形或略呈四棱形，无毛，稀有被微柔毛，具白色皮孔。
叶片椭圆形、椭圆状披针形或倒卵形至倒披针形，长2-8(-13)厘米，宽1-3.5(-5.5)厘米，先端锐尖或短渐尖，基部楔形或宽楔形，稀近圆形，叶缘具短睫毛或无毛，上面深绿色，下面粉绿色，无毛，稀仅沿叶脉略被微柔毛，有时具褐色斑点；叶柄长0.5-2厘米，无毛。
圆锥花序直立，由顶芽抽出，塔形，长5-18厘米，宽3-12厘米；花序轴、花梗均呈紫褐色，被微柔毛；花序轴具皮孔；花梗短，长0.5-1.5毫米；花萼无毛，长1-2.5毫米，截形或萼齿锐尖至圆钝；花冠白色、淡紫红色或淡粉红色，呈漏斗状，长0.7-1.2(-1.7)厘米，花冠管长0.5-0.8(-1.3)厘米，中部以上稍变粗，裂片呈直角开展，长圆形，长2-3.5毫米，先端向内弯曲呈兜状而具喙；花药黄色，长1.8-3毫米，通常位于距花冠管喉部0-2毫米处，稀稍凸出。
果长圆柱形，长1.2-1.7厘米，先端锐尖而具小尖头或钝，稍被皮孔。花期5-6月，果期9月。
