以三塔式移动床为例，操作步骤如下：
（1）进水托层（床）操作进水，将进水装置上部的树脂进行托层（床），从塔顶部空气阀排尽空气，进行离子交换，并出水。控制交换流速为40-60m/h。与此同时，将进水装置下部的失效树脂压送至再生塔顶，送脂完毕关送脂阀。
（2）失效树脂再生送至再生塔的失效树脂，在顶部塔斗经再生废液的预再生，然后藉重力树脂徐徐落下。与此同时，再生塔的底部进水与再生液相配合，配成4%-8%溶液，以8-10m/h的再生流速上升，与从上部下落的树脂相遇进行再生，时间为30-45min。
（3）再生树脂清洗再生好的树脂送至清洗塔斗徐徐落下，塔底部进清洗水，对树脂进行清洗，待树脂落至底部时清洗已经结束，清洗好的树脂存入交换塔的塔斗。
（4）运行终点控制操作运行时间约1h，即为终点，关进出水阀，迅速开大排水阀，打开交换塔顶部放空气阀，空气进入塔体，树脂落床。与此同时，交换塔上塔斗内已经再生清洗好的树脂落入塔内。然后，继续进行进水托层（床）操作。
