在实验室中纯水有很多种应用需求，每一种应用对于纯水的要求都不一样，因此许多组织和团体制定和出版了与超纯水生产相关的标准，这些标准定义了水的纯度水平。而常见的标准有国内的GBT6682-2008实验用水标准、美国材料试验协会（ASTM），国际标准化组织（ISO），美国药典（USP）和临床实验室标准研究所（CLSI）等制定的标准。

实验室每种类型纯水的典型用途如下：

类型1 对于诸如HPLC，HPLC，AA，ICP-MS等分析技术的关键实验室应用如HPLC，流动相制备，空白和样品稀释来说是必需的。哺乳动物细胞培养和IVF的缓冲液和培养基的制备。生产用于分子生物学应用的试剂（DNA测序，PCR）。电泳和印迹溶液的制备。

类型2 用于缓冲液，pH溶液和微生物培养基制备和化学分析试剂的制备。用于临床分析仪，细胞培养箱和湿度计等。还可用作1型系统的给水。

类型3 用于玻璃器皿冲洗，灌装高压釜，加热浴和加湿器，以及一般的化学实验试剂。也用作1型系统的给水。