菊花为多年生草本，高 60-150厘米。茎直立，分枝或不分枝，被柔毛。叶互生，有短柄，叶片卵形至披针形，长 5-15公分，羽状浅裂或半裂，基部楔形，下面被白色短柔毛，边缘有粗大锯齿或深裂，基部楔形，有柄。头状花序单生或数个集生于茎枝顶端，直径 2.5-20厘米，大小不一，单个或数个集生於茎枝顶端；因品种不同，差别很大。总苞片多层，外层绿色，条形，边缘膜质，外面被柔毛；舌状花白色、红色、紫色或黄色。花色则有红、黄、白、橙、紫、粉红、暗红等各色，培育的品种极多，头状花序多变化，形色各异，形状因品种而有单瓣、平瓣、匙瓣等多种类型，当中为管状花，常全部特化成各式舌状花；花期 9-11月。雄蕊、雌蕊和果实多不发育。

菊花为多年生宿根亚灌木。繁殖苗的茎，分为地上茎和地下茎两部分。地上茎高0.2-2米，多分枝。幼茎色嫩绿或带褐色，被灰色柔毛或绒毛。花后茎大都枯死。次年春季由地下茎发生孽芽。 菊花叶系单叶互生，叶柄长1-2厘米，柄下两侧有托叶或退化，叶卵形至长圆形，边缘有缺刻及锯齿。叶的形态因品种而异，可分正叶、深刻正叶、长叶、深刻长叶、圆叶、葵叶、蓬叶和船叶等8类。 菊花的花（头状花序），生于枝顶，径约2-30厘米，花序外由绿色范片构成花苞。花序上着两种形式的花：一为筒状花，俗称"花心"，花冠连成筒状，为两性花，中心生一雌蕊，柱头2裂，子房下位1室，围绕花住主5孜聚药雄蕊；另一为舌状花，生于花序边缘，俗称"花瓣"，花内雄蕊退化，雌蕊1枚。舌状花多形大色艳，形状分平、匙、管、桂、畸等5类。瘦果（一般称为"种子"）长1-3毫米，宽0.9-1.2毫米，上端稍尖，呈扁平楔形，表面有纵棱纹，褐色，果内结一粒无胚乳的种子，果实翌年1-2月成熟，千粒重约1克。

菊花品种具有极大多样性，分类工作者们探讨菊花的原祖。或认为野菊是菊花的原始祖先，或认为甘菊是原祖，或认为它的原祖是小红菊，或者开出一系列的可能的原祖名单。中国科学工作者有的还进行过属间杂交实验，在探讨菊花真源方面做了一些推测性和实验性工作。无论推测和实验，都是试图把菊花的来源落实于该属的某一个或某两个种上，并且试图指出，在这些浩瀚的品种中，哪一个品种最为原始，即是说，想找出最原始的菊花品种。

可以肯定，菊花的来源是多方面，是多元而不是单元起源。菊花是异花受粉植物。人们在长期的实践过程中，运用种间，甚至属间杂交的办法，来获取菊花的新性状，并通过返交、互交等有性过程来获得新性状的分离。这样如此返复的遗传重组合和性状的分离，新性状就越来越多。在这个过程中，有意识的人工杂交和随机的自然选择都可以同时出现或交替发生。但是，去劣择优的人工选择过程，却永远起着主导作用。菊花染色体极其有限。仅记录到菊花是6倍体，2n=54。菊花新品种产生的另一个可能的途径是体细胞的突变（芽变），用固定芽变的办法来获得新品种。