东北茶藨子单果产种子的个数在1-10粒之间，平均单果重为0.35克，每个单果平均产出饱满种子3.2粒，种子的千粒重为7.3克。8月下旬，当东北茶藨子的果实呈红紫色时即可采摘。采摘时，要选择植株生长健壮、无病虫害的果实。采后果实放入盆中，充分搓破浆果，再用清水漂去果肉、果皮等，然后将饱满的种子置于报纸上，阳光下晾晒2-3天，当种子含水率达5-6%时，用塑料袋封存，冷藏于0-3℃的冰箱中。
东北茶藨子的种子具有千粒重小、种皮坚硬、透水透气性差等缺点，其发芽率极低，未经处理直播的东北茶藨子种子其出苗率仅为1-2%，需经过混沙变温层积处理，具体的处理方式为：将调制后的湿种子用38℃清水浸泡24小时，捞出后与河沙（用0.3%高锰酸钾浸泡6小时进行消毒）混匀（种子:湿河沙=1:3V/V）均匀后，置于25-30℃左右的条件下45天，后转至15-20℃的室温下层积，大概6天左右开始有种子发芽，此时需适当增加沙子含水量，出芽持续6天，发芽率较低仅为32%，发芽期间种子的芽较长，可达1厘米，但不影响之后的播种育苗。种子混沙层积期间，注意保持沙子湿润，并每日上下翻动。
5月上旬进行播种。东北茶藨子种子千粒重为7.1-7.5克，属小粒种子，其播种量为1.5克/平方米播种。整地，以宽1.2米、高30-40厘米作床，床面土块打碎、耙细，将种子与多菌灵混拌后，在床面上均匀扬撒播种，之后覆土压实并覆盖苇帘。播种后的7-10天即可出苗。播种后一般每天浇水一次，期间要及时除草，并做好水量的管理，必要时需搭遮阴网。第二年春换床，再培育1年，即可出圃。
