美花红千层在苗期容易发生灰霉病、叶斑病、立枯病危害，特别是春季高湿环境下最易发生上述危害。因此，种苗摆放不应过密，避免病害的快速传播。春季3-5月，每个星期（根据具体的天气情况，高湿阴雨应注重防范）喷施代森锰锌1000倍液、普力克800倍液等药剂预防上述病害。新叶抽出时会有卷叶螟类害虫危害，可以在发现少量害虫出现时，施用氧化乐果1000倍液、迅杀1000倍液等药剂防治。
常见虫害有卷叶螟、蚜虫，严重时成片受害，且不易恢复,影响苗木的生长和质量，卷叶螟常在春季新叶生长旺盛时爆发，日常管理时需加强监控，做好预防工作，可用吡虫啉1000倍液、毒死蜱乳油1000倍液、10%高效氯氰菊酯乳油800-1000倍液等防治。喷施药剂宜选在傍晚或阴凉天气进行，施药后如遇阴雨天气，则需在雨停后补施一次，才能起到良好的杀虫效果。
