病害主要为立枯病，防治方法：①播种前进行土壤消毒，用甲基托布津、退菌特等与土混合配成药土，按每平方米3克撒入播种沟底。②拌种消毒。③播种后加强苗期管理，发病后及时拔除病株烧毁，同时配500-1000倍多菌灵药液进行防治。
野巴旦杏树主要害虫为樱桃粘叶蜂和苹果巢蛾。樱桃粘叶蜂1年发生多代，主要危害叶片。苹果巢蛾一年一代。
防治方法：①人工防治，及时清除长势衰弱和死亡树木，合理修剪，增强树木抗虫能力。于幼虫发生期，人工灭杀幼虫群集叶片，加以消灭。②BT生物制剂防治，以3.0亿或3.2亿孢子/毫升处埋，防治效果较好。③化学防治，使用氧化乐果1000-2000倍液、敌杀死3000倍液，防治效果较好。
