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小叶红豆生长在海拔600-800米的山坡、坡脚、林中。天然群落分布区位于亚热带温暖季风气候区,以山地、低山、中低山为主。主要在海拔700-900米的南哨乡九虎大山,生长在常绿阔叶林及常绿落叶阔叶混交林中。分布区水热条件优越,年均降雨量为1220.5毫米,相对湿度为78-84%,土壤为山地黄壤。
对土壤要求不苛,适生在酸性或微酸性的红壤或红黄壤,但以土层深厚、肥沃的环境生长良好。种子外皮坚硬,不易吸水发芽。林下天然更新较差,但根系萌蘖力强,伐根上能迅速长出萌条。