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1842年,Miquel在其苏铁专著中根据采自印度尼西亚的爪哇的Blume 1089标本建立爪哇苏铁,但作为拳叶苏铁的变种(Cycas circinalis var. javana)。de Laubenfels经研究发现,爪哇苏铁与拳叶苏铁明显不同,于1996年提升为种级。