各级环境保护主管部门在环境监测管理方面的主要职责是：
1、领导所辖区域内的环境监测工作，下达各项环境监测任务；
2、制定环境监测工作及监测站网的建设、发展规划和计划，并监测其实施；
3、制定环境监测条例、各项工作制度、业务考核制度、人员培养计划及监测技术规范；
4、组织和协调所辖区域内环境监测网工作，负责安排综合性环境调查和质量评价；
5、组织编报环境监测月报、年报和环境质量报告书；
6、组织审核环境监测的技术方案及评定其成果，审定环境 评价的理论及其实践价值；
7、组织开展环境监测的国内外技术合作及经验交流。
中国环境监测总站的主要职责是：
1、参与制定全国环境监测工作的规划和年度计划；
2、对各级环境监测站进行业务、技术指导，负责全国环境监测网业务上的组织协调工作，组织环境监测技术交流和各级环境监测技术人员的技术培训及业务考核；
3、组织研究环境监测数据的统计分析方法，收集、储存、整理、汇总全国环境监测数据浆，编制全国环境监测年鉴，绘制环境污染图表，综合分析全国环境质量状况，定期向城乡建设环境保护部提出报告；
4、负责全国环境监测的质量保证工作，组织开展环境监测新技术、新方法的研究，组织研制、生产、分发环境监测标准参考物质，筛选和确信全国统一采用的环境监测仪器装备；
5、承担国家综合性的环境调查和重大污染事故调查，负责国内重大污染事故纠纷和国际纠纷的技术仲裁；
6、参加制订和修订国家各类环境标准和技术规范；
7、参加编写全国环境质量报告书；
8、受城乡建设环境保护部委托，参加国家重大新建、改建、扩建项目环境影响报告书的审查和治理工程环境效益的监测。
省级环境监测中心站的主要职能是：
1、参与制订本区域环境监测工作的规划和年度计划；
2、收集、整理、汇总和储存本区域的环境监测数据资料，为报出各类监测报告提供基础数据，编报本区域的环境污染年鉴；
3、对下级环境监测站进行业务、技术指导，负责本区域环境监测网业务上的组织协调工作，组织本区域内环境监测技术交流和下级环境监测技术人员的技术培训及业务考核；
4、负责本区域内综合性环境监测的质量保证工作；
5、承担本区域内综合性环境调查及环境污染纠纷的技术仲裁；
6、参加制订和修订任务和验证工作及提供依据材料；
7、承担本区域环境质量评价和监测技术的研究，参加编写本区域环境质量报告书；
8、受环境保护主管部门委托，参加污染事件调晒和建设项目影响报千书的审查，进行治理工程环境效益的监测。
市级环境监测站的主要职能是：
1、对本市大气、水体、土壤、生物、噪声、放射性等各种环境要素的质量状况，按国家统一规定的要求，进行经常性监测、分析， 收集、储存和整理环境监测数据资料，定期向同级环境保护主管部门和上级监测站呈报本市环境质量状况和污染动态的技术报告；
2、对本市各有关单位诽放污染物的状况进行定期或不定期的监测性测定，建立和健全污染源档案，为加强污染源管理和排污收费提供监测数据。各地排污收费管理单位不另设测试机构；
3、参加制订本市环境监测规划和计划，完成主管部门为进行环境管理所需要的各项监测任务；
4、负责本市环境评价，参加编写本市环境质量报告书，编制本市环境监测年鉴；
5、负责本市环境监测网的业务组织和协调，组织技术交流和监测人员培训；
6、研究野外作业、采样、布点、样品运输、贮存、分析测定等各得要技术环节中存在的问题，促进监测技术的不断发展；
7、承担国家和地方性环境标准、技术规范、环境测试新技术、新方法的验证任务，参加地方环境标准的制订、修订；
8、参加本市污染事件调查，负责环境污染纠纷的技术仲裁；
县、旗、县级市、大城市区环境监测站的主要职能是：
1、对本县（市、区）内各种环境要素的质量状况按照国家统一规定的要求，制订监测计划和进行经常性的监测。定期向上级站报送监测数据，编报本县环境质量报告书；
2、对县（市、区）内排放污染物的单位进行定期或不定期的监测建立污染源档案，监督和检查各单位执行各类环境法规和标准的情况。为排污收费等环境管理提供监测数据。
3、完成环境保护主管部门为进行环境管理所需要的各项监测任务；
4、参加县（市、区）内污染事件调查，为仲裁环境污染纠纷提供监测数据。
5、宣传环境保护的方针，积极组织和发动群众参加环境监督活动，组织群众性的环境监测网。
各部门的专业监测机构（包括海域或流域的监测机构）主要职能是：
1、参与制订本系统、本部门环境监测规划和计划；
2、参与国家或地区遥环境监测网，按统一计划和要求进行环境监测工作，对所辖方面和范围内的环境善进行监测；负责组织本系统或本流域的环境监测网的活动；
3、参加本部门或地区所承担的各项环境标准制订、修订工作，为其提供制、修订的依据，参加国家或地方环境标准的讨论和审议；
4、参加本系统重大污染事件调查；组织检查所属单位遵守各项环境法规和标准的情况；
5、参加本系统、本部门所属企事业单位新建、改建 、扩建工程的环境影响评价；
6、汇总本系统本流域环境监测数据资料，绘制污染动态图表，建立污染源档案；
7、企业事业单位的监测站，负责对单位的排污情况进行定期监测，及时掌握本单位的排污状况和变化趋势，其监测数据和资料禹资料主管部门报送的同时，要报当地环境监测站，各单位的监测机构参加当地环境监测网工作；
8、组织本部门行业监测技术研究，培训技术人员和开展系统专业环境的职能外，同时要配合地方环境监测站参与环保主管部门组织的有关重大污染事件的调查。
9、卫生、水利、海洋等部门的环境监测站，除负责本系统专业环境监测的职责外，同时要配合地方环境监测站参与环保主管部门组织的有关重大污染事件的调查。
