基金项目的评审一般按照初审、同行专家评议、专家评审组或专业委员会评审的程序进行。自然科学基金委科学部负责申请项目的初审。有下列情况之一者，不予继续评议和评审：

1、申请者不具备申请资格或违反了自然科学基金委的有关规定；

2、申请手续不完备或申请书不符合要求；

3、申请项目主体内容不符合国家自然科学基金资助范围或申请经费超出基金项目资助能力；

4、申请者以往获资助项目执行不力。

同行评议是指同行评议专家对申请项目的创新性、研究价值、研究目标、研究方案等做出独立的判断和评价，一般采取通讯评议方式。

申请者可提出不超过三位不宜评议其申请项目的同行评议专家（须注明所属单位、并说明理由，供遴选同行评议专家时参考。自然科学基金委科学部对此信息保密。

自然科学基金委负责组建专家评审组或专业评审委员会，其成员除具备同行评议专家的基本条件外，还应具有较强的战略意识和较广的知识面。专家评审组或专业评审委员会在同行评议的基础上提出项目资助建议或审定资助项目；参与学科发展战略和项目指南的制订；对基金管理工作等进行咨询。专家参加评审工作时不代表部门和单位，应自觉维护科学基金评审工作的科学性和公正性。

在专家评议评审的基础上，自然科学基金委委务会议对不同层次、不同类型的项目或资助方案予以批准或授权批准，自然科学基金委兼职专家在任期间申请的项目须专门审查批准。