(1)当系统需要脱泵停车时，施工主船必须逐步降低施工泥浆浓度至向管道内泵送清水(此阶段接力泵船按原规定的转速运行)，施工主船首先要依据清水在排泥管线中运行的流速，结合总排泥管的长度，推算出清水至管线排出口所需时间，并指令接力泵船按推算出的时间进行正常脱泵。
接力泵船接到施工主船指令后，必须严格遵照施工主船的指令，在规定的时间脱开泵机离合器并告知施工主船，接力泵船泥泵已处于脱泵状态。
(2)施工主船得知接力泵船脱泵停车后方可自行脱泵，并将施工主船脱泵的情况以及脱泵以后恢复正常施工所需时间告知接力泵船，以便接力泵船做出相应措施，并保持通信畅通。
