专项工程预算审计是对企业专项工程预算进行的审核、稽查。要点包括： (1)从程序分：①程序性审查。审查工程项目是否有设计文件，施工图纸和预算文件，且有无审批手续。②实质性审查。审查工程规模、建筑结构、工程效益的可行性、科学性。③预算内容审查。审查预算项目、预算计划、预算开支的合理性、合法性。
(2)从工程预算上分：①工程预算审查。审查建筑工程量计算是否止确、工程造价是否合理、施工费计算是否恰当。②设备及安装工程预算审查。审查设备费用、规格，数量是否合乎设计要求，设备价格是否合理，等等。③综合预算审查。把各单位工程预算和有关费用预算汇总，审查其是否符合总预算。(3)审查工程预算中有无重算、漏算、错算的情况，有无故意虚列预算，弄虚作假的情况。
