地下水开采不合理，会引起区域地下水位大幅度下降，水资源枯竭、地面沉降和水质恶化等公害。例如，中国上海市地面沉降了2.63米；日本东京地区地面沉降了3.7米;墨西哥的墨西哥城地面沉降达7.9米;中国西安、成都产生了已受污染的浅层水越流补给并污染深层水的现象；大连市海水侵入含水层，使一些井水的矿化度增高而不能使用；美国加利福尼亚州洛杉矶的沿海平原，海岸附近的地下水位降到海平面以下31米。相反，如果不认识地下水资源的可恢复性这一特征，片面强调不得动用储存量，不能进行大降深开采，而使一部分地下水得不到充分利用，这同样是地下水开采的不合理现象。
