内设办公室、技术开发科（总工室）、审核科（南宁市防雷中心）、监管科、广西区雷电灾害风险评估所、广西区防雷工程质量监督所（南宁市防雷工程质量监督所）、广西区雷电监测所、广西区防雷检测所（南宁市防雷检测所）6个职能科（室、所）。
广西壮族自治区防雷中心
拥有检测仪器及相关设备86台(套)，包括接地电阻测试仪、精密静电电压测量表、数字式漏电流测试仪、防雷元件测试仪、电涌保护器测试仪、表面阻抗测试仪等专业测试仪器，以及现代化办公设备。通过了计量认证，是全区防雷技术力量强、设备先进、经验丰富、专业水平最高的防雷机构。
