与其他采购方式相比，协议供货制有自身独特的优势：

一是可以节约资金。相对于各个部门的零星采购而言，协议供货制是由中央单位将零星采购集中起来，形成一个比较大的采购数量，从而对广大供应商产生一定的吸引力，使其积极参与并自降价格，这样对于广大的用户是非常有好处的。

二是减少供应商的销售成本。如果每一个需要产品的用户都独自采用政府采购的其他采购方式来进行采购，那么所有的供应商将疲于奔命，买相类似的标书，奔跑在不同的开标地点。这样一来，高额的销售成本给供应商带来的压力是可想而知的。

三是协议供货制以其规范的操作程序，使整个采购过程更加透明，更加规范。

四是便于采购管理监督部门对中标供应商的售后服务进行监督。同时，也有利于审计、监察部门对采购单位执行政府采购制度的情况进行检查。

五是节约采购机关的采购成本。无论采购数量大小，采购成本是一样的，不会随采购数量的大小而增减采购的环节。

总而言之，政府采购协议供货制是将采购效益与采购效率有机结合并找到最佳结合点的一种采购方式。