在地热回灌中, 经常由于堵塞而使井的回灌能力降低。堵塞的原因包括物理的和化学的。物理堵塞主要是由于水中含有的悬浮物颗粒, 在回灌压力的作用下附着在回灌井壁上或进入热储的裂隙中而影响回灌能力。此外, 回灌水中的气泡也可能影响回灌的速度。

为了避免或减轻物理堵塞, 可以用过滤的方法去除水中的悬浮物, 然后再进行回灌。当回灌井的水位低于地表时, 应在回灌井中安装回灌管, 使回灌水通过回灌管直接到达井水位以下, 以避免回灌水在井筒中自由下落过程中混入气泡, 从而影响井的回灌能力。化学堵塞是由于物理化学状态的改变或回灌水与地热水之间的化学反应而产生沉淀(主要为二氧化硅或碳酸钙等), 从而降低井的回灌能力。在高温地热田, 发电后的地热水的化学组分浓度增加, 温度和压力降低, 可能形成过饱和溶液, 产生沉淀析出。空气的作用也可能加速沉淀作用。因此, 在设计回灌系统时, 应研究合理的回灌水温度和工作压力, 尽可能避免产生化学沉淀而影响井的回灌能力。还应注意保证系统的密闭性,尽量避免回灌水和空气接触。在可能产生沉淀的化学组分含量较高时, 可以通过调节回灌水的pH值避免化学沉淀的产生。