工程硕士教育从1984年提出，1997年国务院学位委员会批准设置工程硕士专业学位，经历了从试点到奠定工程硕士人才培养模式的阶段。又自从奠定了人才培养模式后，工程硕士教育从9个培养单位、10个工程领域、年招生1千多人，发展到2004年的180个培养单位、38个工程领域、年招生3万多人、在校生10万余人。我们的工程硕士教育诞生于中国经济体制转型期，既是应社会需求而产生，也是研究生教育发展的必然结果。实践证明，工程硕士专业学位是一种适合我国国情的学位类型和人才培养规格。从发展的势头看，工程硕士教育充满着活力。在当今贯彻科教兴国、可持续发展和人才强国三大战略，全面建设小康社会的时期，学位与研究生教育如何发挥更好的作用，值得我们认真地研究和规划。
从学习上来看，前者双语教学，老师一般三三制，即学校导师、企业技术骨干、外籍教师组成。与工学硕士有所不同，一个为校内指导教师，另一个为校外指导教师。从培养模式来看，前者注重应用，后者注重学术研究。从培养目标来看，前者培养复合人才，主要是计算机 管理。后者培养学术尖兵。
入学的途径有两种：1、通过一月份国家研究生统一入学考试入学（2017级研究生开始实行）。2、通过十月份国家工程硕士专业学位研究生入学考试入学（十月考试已取消）。
为使工程硕士专业学位规范管理、稳步发展，经中华人民共和国国务院学位委员会考核验收，已下发（1997）57号文批准全国70多所高校具有工程硕士学位授予权，清华大学、哈尔滨工业大学、华中科技大学、中南大学、北京航空航天大学、华南理工大学就是其中的几所被批准有工程硕士学位授予权的高校。这些高校在加速培养国家急需的高素质工程技术和工程管理人才方面做出了巨大贡献。
每一所高校都有自己的发展历史，有自己的核心专业研究领域，它们充分发挥现有资源，形成各自有特色的研究方向，取得了多项具有理论价值和生产实践效益显著的研究成果。
2009年国家为了弥补学术型硕士实际操作能力差的特点，允许各学校培养全日制专业型硕士，其中全日制工程硕士占了很大比例。与以往GCT在职工程硕士不同的是，全日制工程硕士进行全日制的培养，毕业可以领学历证和学位证，从此全日制工程硕士与全日制工学硕士地位平等。
根据教育部的要求每年会减少工学硕士而增加工程硕士，培养方面工程硕士比工学硕士要求有更多的实践经验，从而对学校的培养提出了挑战，因为这不同于GCT在职工程硕士，全日制工程硕士的培养要求学校有实践培养基地，对学校的教育经费和培养方式构成不小的挑战。
