工程学院下设4个系、1个教学部、1个实验中心：岩土工程与工程地质系、土木工程系、勘察与基础工程系、安全工程系、力学教学部、工程学院实验中心。设有专业科研机构12个：勘察建筑设计研究院、爆破开发研究中心、土木工程研究所、超硬材料研究所、环境工程设计研究所、城市地质工程技术研究中心、岩土工程研究所、安全工程研究室、钻掘与基础工程研究所、区域环境与灾害防治研究中心、地铁与隧道工程研究室、掘进工程研究所、地质灾害治理研究所。
工程学院正形成以地质工程学科群与岩土工程学科群为龙头的，集教学、科研、生产为一体的学科综合优势。其研究范围己涵盖地质工程、土木工程、矿产能源勘探与开发、水利水电工程、地质灾害防治、安全技术及工程等领域。学院的建设目标是在本世纪初，办成在国内领先、国际上有影响的，集教学、科研、开发于一体的重要的工程技术人才与学术研究基地。
