学院下属三级单位：油气井工程系、采油工程系、油藏工程系、油田化学系、海洋工程及流体力学系、金刚石钻头研究室、高压水射流研究中心、学院办公室
科研机构：油气井工程研究所、油气田开发工程研究所、油田化学研究所、海洋石油工程研究所
院属学科：油气井工程学科、油气田开发学科、流体力学学科、海洋结构物学科
省部级研究机构：山东省油气井工程重点实验室、中国石油天然气集团公司高压水射流研究中心、山东省高压水射流新技术研究推广中心、中国石油天然气集团公司采油工程软件开发与信息中心、中国石油化工股份有限公司提高油气采收率研究中心、山东省油田化学工程技术研究中心
学校研究机构：中国石油大学天然气水合物研究中心、中国石油大学泡沫流体研究中心
