中山大学地球科学与地质工程学院的前身为国立中山大学自然科学科矿物地质系，是中国综合性大学中最早创办的地质学教学和研究机构之一。

1924年2月4日孙中山将国立高等师范学校、广东法科大学和广东农业专门学校合并，成立国立广东大学，并在理学院下设立矿物地质系，成为数、理、化、天、地、生的六大基础学科之一，有着重要的历史地位。1925年8月17日为了纪念孙中山先生，将国立广东大学更名为国立中山大学。1927年9月，在谢家荣和朱家骅的倡议下创办了两广地质调查所，行政上接受中山大学和国民政府双重领导。

中山大学地质学系成立初期人数虽少，然而十分重视教学质量，是当时全校教学质量较高的学系之一。1926年，系主任黄著勋教授著《中国矿产》，并由商务印书馆出版，是中国最早的矿物学、岩石学、矿床学著作之一。此外，矿物地质系十分重视引进国外科学技术和先进的教学方法，如聘请国外教授、采用国外原版教材、加强野外实践环节等。例如1928年引进了德国古生物学家叶格尔(O.Jaekel)教授任系主任，1929年聘请了瑞士的哈安姆(A.Heim)教授来系任教，1936年聘请了米士(P.Missh)教授担任构造地质课程主讲。两广地质调查所的研究人员还兼任系的教学工作。科研与教学的结合使学生受到了真正的锻炼。当时，在教的教师包括朱家骅、谢家荣、朱庭祜、冯景兰、乐森璕、李学清、张会若、李殿臣等地质学家。

中山大学地球科学与地质工程学院90多年的发展历程中，在历届主任和教师的努力下不断发展壮大，1924年的首任主任为黄著勋教授，之后的历届主任或主持工作的教授有朱家骅、叶格尔(O. Jaekel)、哈安姆(A. Heim)、张席褆、何杰、杨遵仪、陈国达、李翼纯、潘钟祥、林挺、曹廷藩、陈志中、方瑞濂、黄玉昆、李兆麟、赵不亿、陈国能、周永章、郑卓等。