供电可靠性较低：因为中性点直接接地系统发生单相接地时，短路电流很大，必须断开故障电路，中断对用户的供电，故供电可靠性较低。为了提高供电的可靠性，在中性点直接接地系统的线路上，广泛装设自动重合闸装置，当发生单相短路时，继电保护将电路断开，经一段时间后，自动重合闸装置再将电路重新合上。如果单相短路是暂时性的，线路接通后对用户恢复供电，如果单相短路是永久性的，继电保护将再一次断开电路。据统计有70%以上短路是暂时性的，因为重合闸的成功率在70%以上。

单相短路电流很大，中性点直接接地系统发生单相短路时，相当于将电源的正负极直接短路，故短路电流很大，可能须选用大容量的开关，增加了投资。

中性点直接接地系统发生单相接地时，很大的单相电流只在一相内流过，在三相导线附近产生，较强的单相磁场，在这个单向磁场会在附近的通讯路感应电势，产生电磁干扰，故在设计电力线路时要考虑与通讯线路保持一定的距离，避免与通讯线路平行，以减少电磁干扰。