（1）针对性

生态系统的许多特征指标值具有比较固定的随时间变化而往复振荡的特点，同时，由于生态系统本身固有自我修复或再生的能力，即对外界条件的有限变化具有较大的缓冲能力。因此，许多指标不需要经常测定，往往只需要几年测定一次来反映可能的长时间积累性变化。这样就给优先监测指标的选择留下较宽的余地。优先指标主要放在那些与生态系统本身改变或外界条件改变的作用力最大的因素有关的指标。

（2）适时性

不同时代或历史阶段，人类活动特点与强度不同，对生态系统造成的压力不同，生态系统改变的主要矛盾方面也不同，因此，不同时代选定的优先监测指标也会因实际情况不同而有所变化。比如我国当前主要是污染和经济开发强度大，保护生态系统的技术水平与措施较弱，因此当前污染与开发影响表现为主要矛盾，与这些压力有关的生态指标通常应确定为优先监测指标。未来的污染类型、方式及开发影响都会改变，到时候监测的优先指标也将随之变化。此外，当前的监测能力、技术与设备水平、对生态系统的认识程度等，也是确定优先监测指标的一类不可忽视的条件。

（3）系统类型

不同生态系统具有不同类型的特征生态指标，因而也就有其不同的优先监测指标，这是不言而喻的。比如水体透明度对水域生态系统中植物光合生产力和水生动物生存状态有很大的影响，而陆生生态系统则不可能有这样的优先监测指标。