(1)自然陆生生态系统
①森林生态系统 当前重点应放在污染(SO2、酸雨、O3)对森林生态系统的影响指标、森林生长量指标、火灾、虫害影响指标、酸雨引起土壤酸化指标,森林面积变化及森林垦荒、破坏指标以及林区生物多样性改变(特别是珍稀濒危物种)等方面的指标。
②荒漠生态系统 当前重点应放在荒漠化面积扩大、准荒漠化地带植被量和过牧、过度樵采情况,荒漠地带水系改变以及人口、农牧业发展的情况方面的指标。
(2)农业生态系统
①农田(包括农垦区)生态系统 当前重点应放在土壤、农作物和农用水源污染,土地利用改变,农区植被破坏,病虫害发生情况,天敌物种变化,农垦区野生动物改变以及农用生物种和品种数量改变等方面的指标。
②草地生态系统 当前重点应放在草地面积变化,草地生产力变化.放牧强度,草地沙漠化程度和发展趋势,南方草地被垦殖和水土流失情况等方面的指标。
③水产水域生态系统 当前重点应放在水体污染、富营养化,水体利用改变,水域面积和水源枯竭情况,养殖与捕捞情况,水域水产物种改变等方面的指标。
(3)淡水生态系统
大致同于水产水域的优先指标,其中湿地还要重点监测重要水鸟、两栖类和兽类动物的物种和种群改变情况等方面的指标。
(4)海洋生态系统
大致同于水产水域生态系统的优先指标,同时要注意监测赤潮发生情况,河口流量与水质改变,海岸带开发利用情况,石油开采的污染和生态影响等方面的指标。 2100433B