截止到2001年研究生部并入北京工业大学之前，研究生部设有水工结构工程、水力学及河流动力学、水利水电工程3个专业，高坝结构可靠度分析、非线性科学及其在水工结构分析中的应用、泄水建筑物水力学、计算水力学、节水灌溉新技术、工程建设标准化、水利水电工程经济管理、水利水电工程施工机械新技术开发、水力发电装置的运行与管理等近20个研究方向。
经原国家教委批准水工结构工程、水力学及河流动力学两个专业具有单独考试培养工程硕士的资格 。
目前，华北水利水电学院已发展成为一所有12个硕士学位授权一级学科点，58个学术型硕士学位授权点、14个专业硕士学位领域，全日制在校本科生、研究生20 074人，以工学为主干，工学、理学、管理学、社会学科、人文学科和农学等6大学科门类协调发展的高等学校。
