厦门海洋工程勘察设计研究院承担了西北太平洋海洋环境综合调查、我国近海海洋综合调查与评价、国家外大陆架专项、国家水合物专项、大洋专项、海域勘界等大型海洋调查与研究工作;承担了包括973、国家基金、福建省重大专项前期、福建省重点基金、国家海洋局青年基金、科技部系统改造升级、欧盟国际合作、海洋公益性专项等研究工作;并完成了大亚湾、宁德、福清、漳州、广西白龙、海南昌江等核电厂场址海域地球物理、海洋工程环境调查和海域使用论证,厦门香山国际游艇码头工程环境勘察和设计、厦门环岛路(香山—长尾礁)岸段沙滩修复、环东海域综合整治建设工程项目等大、中型海洋海岸工程勘察设计咨询论证工作。发表论文300多篇,出版专著10余部。为国家海洋资源开发、海洋环境保护、防灾减灾、国家权益维护以及海洋工程建设等提供了准确可靠的科学数据和技术支持,取得了良好的经济和社会效益。