输水干线包括总干线、长春干线、四平干线和辽源干线。输水支线为从干线或调节水库至各受水城市或附近水库的线路。输水线路总长550.6km，其中输水干线线路全长266.3km，输水支线全长284.3km。
输水总干线东起丰满水库，向西南经过永吉县城南侧，向西跨过温德河、岔路河，从星星哨水库上游通过，至饮马河分水入石头口门水库，经水库调节后向九台市、德惠市供水；经过双阳水库上游双阳河处，分水入双阳水库，经水库调节后向长春市双阳区供水；继续前行至伊通河右岸丛家分水枢纽止。输水总干线全长110.0km。
冯家岭分水枢纽位于新立城水库库尾上游10.5km处。由长春干线分水口、上游调压井、四平提水泵站、辽源提水泵站等组成。
长春干线分水口位于冯家岭分水枢纽调压井上游80m处，由总干线分水放入伊通河，入新立城水库，经水库调节后向长春市及农安县供水。长春输水干线全长11.2km。
四平干线和辽源干线分水口均位于丛家分水枢纽。四平干线经四平泵站提水至240.00m高程后，向西穿过伊通河至公主岭分岔口，向公主岭市供水；分水之后折向西南，沿长平高速公路引水至下三台水库，经水库调节后向四平市和梨树县供水。四平输水干线全长95.3km，设1级提水泵站，净扬程为17.5m。
辽源干线经辽源泵站提水至285.50m高程后，向南沿长伊公路附近伊通河支流将水引至伊通县附近，分水供伊通县之后，经李家泵站提水至326.00m高程后，输水入金满水库，经水库调节后向辽源市和东辽县供水。辽源输水干线全长49.8km，设2级提水泵站，总净扬程为116m。
输水总干线取水口位于丰满坝上库区左岸，距大坝约1.2km处，设计引水位为242.00m，（丰满水库正常蓄水位为263.50m，死水位为242.00m）。输水线路总干线隧洞设计断面采用圆形断面，成洞洞径为7.0m，其中掘进机段开挖直径采用为8.3m，采用现浇钢筋砼衬砌。输水支线为从干线或调节水库至各水库或供水城市的线路，共13条支线。分别为长春支线、农安支线、九德支线、九台支线、德惠支线、双阳支线一、双阳支线二、四平支线、梨树支线、辽源支线、东辽支线、公主岭支线、伊通支线。
输水支线全长284.3km。其中隧洞长13.9km，埋管（包括PCCP和PCP）长为270.4km。九台、德惠支线进口设置一座提水泵站，净扬程为17.5m。
农安支线工程从新立城水库取水，设计引水规模为2.6m3/s，由鹅头岭泵站、供水管线及交叉建筑物组成，由于农安缺水严重启动应急（一期）供水工程，引水流量0.55 m3/s，线路总长102.665km。
长春玉米工业园支线日供水量为24.5×104t，供水保证率97%，取水泵站位于石头口门水库左岸，由引水渠、进水池、主厂房、副厂房、换路间及开关站等建筑物组成，供水管线总长为27265.8m，管道设计流量为3.30m3/s，设计管径为1600mm双管，管材主要为PCCP或PCP。
