同济大学电子与信息工程学院电气工程系是由上海交通大学原机车车辆工程系电力机车专业发展而来。

1956年3月，上海交通大学运输起重机械制造系正式成立电气机车专业和电气机车教研室。1960年，运输起重机械制造系因专业调整改为机车车辆工程系，设有电力机车等3个专业，5年制本科。

1973年6月，上海交通大学机车车辆工程系并入上海铁道学院成立机械系。

1981年6月，机械系改为机电系。

1984年5月，电气工程系在机电系基础上成立，设电传动专业。同年9月，根据教育部统一专业目录，电传动专业改称电力牵引与传动控制专业。

1985年9月，电气工程学增设电器和电子仪器与测量技术专业，2年制专科。

1987年9月，电气工程系电子仪器与测量技术专业改为4年制本科。

1990年9月，电气工程系增设供电工程专业，4年制本科。

1995年5月，上海铁道学院与上海铁道医学院合并成立上海铁道大学。电气工程系整建制并入保留原名称。

2000年4月，同济大学与上海铁道大学合并。同年8月电气工程系整建制并入同济大学电子与信息学院保留原名称，本科专业设置为电气工程及其自动化。

2005年，获得电气工程一级学科硕士学位授予权。