多层赤泥沉降槽的结构是槽体用锥形隔板分隔成等高的层，为了获得最浓缩的赤泥，清液带的高度只限制在0.2-0.4米，这是为防止在沉降制度突然变化的情况下，浑浊液进入溢流所必须的。在两层的圆筒部分高度相同的情况下，下层容积比上层小，相差一个锥体的容积；在上下两层清液带的高度相同时，下层的清液量要比上层的少得多。
对直径16米的沉降槽来说，当清液带的高度为0.5米时，上层的清液量为100米3，而下层只有40米3。在过去的几年中，有些研究者认为，将进料筒更深一些插入泥层，和加高沉降槽的总高度，可以提高沉降槽的产能。清液是由圆筒中心放射状地向边缘移动，向溢流取样口移动。在固体颗粒沉降的过程中，个别的颗粒或小的絮凝体从沉降带被上升的液流带到清液带，并且在条件好的时候还可以再次沉降。从流体动力学得知，固体颗粒的自由沉降速度与纵向液流速度成正比关系。只要增加清液带的溶液量，就可降低清液射流的速度，借以实现颗粒的二次沉降 。
