在进行初步设计以后，须对系统进行优化。对系统优化能够显著提升设备利用效率、系统经济性及环境效益。优化变量通常包括原动机的类型、容量，系统的运行策略等。
通常从运行现场采集得到的数据一般更准确、真实，基于这些数据进行优化也更为可靠，但获得实际运行数据需要花费大量的时间并需要高昂的运行费用作为支撑，并且只能对具体的某个系统进行研究。使用瞬态仿真方法对系统进行优化，效率高，费用低，系统运行条件(包括原动机类型、容量、当地气候等)更改简便，因此大部分现有研究均采用计算机仿真对多能系统进行优化。常用的优化算法有混合整数线性规划法、混合整数非线性规划法、随机优化法、遗传算法等。2100433B
