据2018年5月研究院官网显示，研究院拥有各类资质27项，其中甲级（国家级）12项、乙级（省级）12项、其他级3项。专业涉及水文水资源调查评价和论证，水土保持监测和方案编制，水利工程咨询、监理、设计、招标代理，以及工程检测、司法鉴定和自动化技术等方面。
截至2018年3月，研究院拥有水文水资源调查评价甲级、建设项目水资源论证甲级、水土保持监测甲级、水利工程建设监理甲级、水利工程质量检测（岩土、混凝土、金结、机电、量测）五个甲级、开发建设项目水土保持方案编制乙级、工程咨询乙级、水利工程设计（灌溉排涝、河道整治）专业乙级、水利工程设计水利行业（水库枢纽）专业丙级、建设工程质量检测综合资质、国家和省级计量认证与资质授权证书、招标代理、建设工程质量检测司法鉴定资质、自动化技术等各类资质（资格）26项。
