山东建筑大学计算生物学研究所成立于2013年，由山东建筑大学审批，研究所依托计算机科学与技术学院，现有成员17人，其中有校外兼职教授7人，校内专职人员10人。
研究所主要研究方向为算法分析与设计、近似算法、计算生物学、生物信息学理论与实践中的算法及其复杂性、人工智能与模式识别；
近年来，研究所努力开拓国际视野，积极跟踪国内外最新进展，承担国家自然科学基金（面上项目），山东省自然科学基金（面上项目），山东省科技发展计划项目，国家住建部科技计划项目，山东省优秀中青年基金等国家级及省部级以上项目十余项，发表SCI/EI检索论文100余篇，获国家发明专利5项。
