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中心配备有原子荧光光谱仪、原子吸收分光光度计、气相色谱仪、水质自动监测仪、液相色谱仪、αβ测定仪、紫外分光光度计、SYG-1型测汞仪、生化培养箱、COD快速测定仪、红外测油仪、数字式酸度计、电导率仪等先进分析仪器设备,可进行地表水(含农灌用水、渔业用水和景观用水)、地下水、饮用水、污废水、大气降水、土壤与底质、水文要素等七类68个项目的检测分析。