办公室：主任：黄勋

负责文电、会务、机要、档案等机关日常工作；承担信息、调研、信访、保密、政务公开、新闻发布工作；负责对本局重要决策和工作部署的督办和检查；负责局机关内部规章制度建设。

财务科：科长：袁灿燚

指导全市水利行业的财务、会计管理和国有资产监管工作；编制水利部门预算；承担局机关并指导直属单位的财务管理工作；承担全市水利资金和局直单位国有资产的监督管理工作；负责局行政事业收费统一管理工作。

规划计划科：科长：曹伟东

研究提出全市水利发展中长期规划和年度投资建议计划；拟订主要河流的流域规划；组织编制并实施全市重大水利综合规划、专业规划和专项规划，归口管理全市水利规划编制和审批工作；负责审查大中型水利工程项目建设书、可行性研究报告和初步设计；组织协调流域开发工作；组织防洪规划工作；负责全市水利综合统计工作。

建设管理科：科长：郑文志

指导水利工程建设与运行管理；负责全市水库、水闸、江河堤防与城市防洪工程的建设管理；指导水利建设市场的监督管理；指导农村水利工作。

行政审批科：科长：方腊梅

根据授权，统一受理、承办和组织办理本单位所有行政许可、行政服务及行政事业性收费等事项。

人事科：科长：余景胡

负责机关和直属单位的人事管理、机构编制、劳动工资、保险福利、教育培训工作；负责专业技术干部职工应聘和工人技术等级考核和职业技能鉴定等工作；指导全市水利体制改革和全市水利队伍建设工作。

纪检监察室（加挂审计室牌子）：主任：任泽晖

负责对局机关及直属单位财务收支、经济效益、经济责任、基本建设等情况进行内部审计。

机关党委

负责局机关局和直属单位的党群工作，与人事科合署办公。

政策法规科：科长：杨大智

承担局机关有关规范性文件审核工作和重大行政决策合法性审查工作；拟订全市水利法制建设规划并监督实施；研究水利工作的政策，起草有关规范性文件草案并监督实施；承办局行政诉讼、行政复议工作；负责水法律法规的贯彻实施及行业普法宣传教育工作；负责水利规费征缴工作的监督；指导重大涉水违法事件的查处；承担跨县市区水事纠纷的协调、仲裁工作；指导水政监察和水行政执法工作。

水土保持科：科长：邹文雄

承担全市水土流失综合防治工作；组织编制全市水土保持规划并监督实施；组织水土流失监测、预报并公告；审核建设项目水土保持方案并监督实施；负责水土保持规费征收制度的实施。

安全与质量监督科：科长：汪智源

指导并监督全市水利行业安全生产工作，承担局系统安全生产监管工作；指导水库、水电站大坝的安全监管，指导实施水利工程质量和安全监督。

离退休人员管理服务科：科长：陈大进

负责局机关离退休人员管理、服务工作，指导直属单位离退休人员管理、服务工作。