新疆水利学会，团结广大水利科技工作者，在新疆水利事业中发挥了桥梁和纽带作用，是一个有活力、有凝聚力、并有较大社会影响的学术团体。随着改革开放的不断深入，新疆水利学会不断发展壮大，1999年经过重新登记注册，现有会员4022名。下设学术委员会、青少年工作委员会、科普工作委员会、学会办公室、科技服务部、ISO9000认证办公室。现有专业委员会21个（水法、环境水利、水利经济、洪旱灾害防治、水工建筑、勘测、水文、水电、农水、施工、地下水、泥沙、岩土力学、灌溉、水利志史、水利规划、科技情报、水利管理、牧区水利）。有分会17个（头屯河管理处、厅玛河管理处、新疆水利水电学校、水利水电科研院、水文水资源局、水利水电建设工程局、新疆农业大学水利分院、新疆大学地理系、新疆水利水电勘测设计研究院、兵团水利局、喀什盖孜河管理处、喀什葛尔河管理处、新疆风能公司、水磨河管理处、塔里木河管理处、金钩河管理处、汇通水利电力工程建设有限公司、喀什水校、额河建管局、乌鲁瓦提建管局）。各地州（市）水利学会有16个。近20年来，新疆水利学会积极开展学术活动。与中国水利学会共同召开的学术讨论会议主要有：全国渠道防渗学术讨论会、全国低水头引水防沙枢纽学术讨论会、全国水工建筑物抗冻技术学术会、西北水文会议、西北片水管科技情报会暨灌溉技术学术座谈会、西北五省第七次水资源合理开发利用学术研讨会等。随着大西北战略部署的实施，我会参与组织或与相关学会共同组织主办了一系列学术会议：如《塔里木河流域水资源环境与管理》学术研讨会、《干旱区生态农业建设与可持续发展》学术研讨会、《发挥新疆资源优势，坚持高效持续发展科学论坛》，新疆大学分会与塔管局分会在乌市召开了《新疆水资源开发利用与环境问题》国际学术论坛会。水文专业委员会召开了《99新疆大洪水学术研讨会》。此外，还多次邀请了美国、丹麦、日本、以色列等外国专家和国内知名专家来疆讲学，做学术报告。