上海射线应用研究所成立于1980年，是上海市科委直属的研究所，原挂靠上海科技大学，1994年5月并校后挂靠上海大学，现挂靠上海大学环境与化学与工程学院。射线应用研究所一直与国际原子能机构（IAEA）保持密切的合作关系，上海科技大学时期曾受IAEA委托举办了4次亚太地区辐射交联技术培训班，并有教授担任IAEA的中国国家项目协调员。目前该所是拥有齐全的辐照设备及完备的检测分析设备，包括电子加速器两台、中子发生器、30万居里钴源等，并且具有先进的束下装置及监控和遥控装置。是国际原子能机构指定的亚太地区核技术在环境中应用的培训基地，并与美国西雅图华盛顿大学、英国布里斯托尔大学、新加坡南洋理工大学、日本原子能研究所、韩国原子力研究所等建立了长期合作关系。

上海射线应用研究所具有完整的测试设备和设施先进的生物分析设备，已建立了POPs分析实验室、环境光化学反应实验室、纳米化学与生物学实验室。在毒害有机污染物，特别是在辐射应用及物质检测方面具有较强的研究实力和仪器设备。设有以下4个专业方向：

辐射技术在环境中的应用

用辐射技术处理污水、污泥；用辐射技术处理难降解有机物、难降解有机的辐解产物及机理的研究。

辐射化学

研究方向主要有三个：1.高分子材料的辐射改性，包括辐射交联和辐射接枝；2.纳米材料的辐射制备；3.有机物辐射化学的研究，包括乏燃料后处理涉及的一些新型试剂的辐射稳定性、辐解产物及机理的研究。

辐射物理

用实验和计算机模拟两种手段，研究高能粒子与物质相互作用的机理及相关的辐照效应、粒子输运的理论模型和计算方法，来解决辐射领域相关问题。

核分析

核反应分析、快中子分析以及快中子测爆系统的研究，完成系列微量元素的分析。以快中子活化分析方法为主体，对探测技术、数据采集系统、计算机软件都进行配套研究。