乌鲁木齐市地方税务局为乌鲁木齐市人民政府的直属机构，受乌鲁木齐市人民政府和自治区地方税务局双重领导，是按国家税法在乌鲁木齐市行政区内实施国家税收征收管理的行政执法机关。

2002年体制改革，市局机关内设机构有：办公室、人事教育处、纪检监察室、政策法规处、征收管理处、计划财务处、信息管理处、税政一处、税政二处、机关党委、机关服务中心、机关培训中心，2009年增设巡视办。乌鲁木齐市地方税务局直管八区一县地税局。乌鲁木齐市地方税务局为正处级单位，下辖的经济技术开发区地方税务局为正处级单位，内设科室（办公室、法规科、计征科、管理科）为正科级单位。高新技术产业开发区地方税务局为正处级单位，内设科室（办公室、法规科、计征科、管理科和一个苏州路税务管理所）为正科级单位。2006年机构改革时成立的稽查局为副处级单位，内设办公室、人事教育监察科、政策法规科、举报中心、稽查所（九个）、审理所（两个）、执行所（两个）均为正科级单位，其他区、县局为正科级单位。基层区、县局下设股级管理所、税务所、征收所、法规科和其他集中办公室、人事教育科、监察室于一体的行政综合类职能科室共计77个。2008年根据国家税务总局和区局关于税收管理专业化的要求,我们成立了市局直属分局筹备组,负责对承担房地产税收一体化管理的直属局的组建工作。全系统现有人员编制1230名,实际在职在岗干部职工1256名，其中：男性男693人，占总人数的55.18%；女563人，占总人数的44.82%。全局少数民族干部219人，占总人数的17.44%；党员580人，占总人数的46.18 %；干部知识结构：研究生学历8人，本科学历527人，大专学历440人，中专学历64人，大中专以上学历占人员总数的82.72%。