在税收征管方面，厦门市地税局采取以属地管理与行业管理相结合的管户划分原则，在市区范围内实行“一级稽查”体制，形成以日常管理（以纳税评估为主线）、税务稽查（以查案为主线）和法规部门（检查监督）三者互相配合、互相制约机制。到2009年，全市地税系统管征纳税户共14.35万户，其中：企业9.17万户、个体工商业户5.18万户。除地方税收的征管外。厦门市地税局还率先在全省实现社保“五险”地税征收工作，其中2009年全市基本养老保险参保人数达到125.28万、城乡全民医保参保人数78.8万。2009年，厦门市地税局共组织各项收入245.09亿元,其中税收收入（不含耕契两税）156.14亿元，五项社保费68.52亿元。
