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巴市水科所建于1957年，前身是中科院河套土壤改良站，是内蒙西部规模最大，集水利科研、水土环境监测、水处理技术服务于一体的研究机构，主要针对灌区水利建设管理中出现的生产问题开展试验研究。经过50年的艰苦历程，在盐碱地改良和节水灌溉领域形成了优势学科，完成科研项目60多项，其中获国家专利1项、科技进步奖22项（国家1项、内蒙8项、巴市13项）。
