根据上述职责，忻城县水利局设2个内设机构。

（一）办公室

协助局领导对各站、室工作进行综合协调，组织机关日常工作；草拟本局阶段性的工作小结和年度工作总结；负责重要会议的组织和接待工作；负责宣传、文秘、行政、档案、保密、信访管理；负责建立本局内部规章制度并监督实施；负责制定机关后勤服务规定，负责基建和国有资产管理监督工作；负责局机关及局属二层单位的机构编制、人事和教育管理工作；职称改革和专业技术人员的职称评定和申报、工人技术等级考核和技师任职资格的评定和申报工作。组织开展思想政治教育和指导全县水利系统职工培训工作；负责局机关的党群工作；负责局机关及局属二层单位离退休人员的管理与服务工作。

（二）财务室

负责编制县本级水利部门年度预、决算并负责预算的执行；承担县本级水利建设资金的监督管理工作；承担局机关并指导局属二层单位国有资产、政府采购和非税收入管理工作；负责局机关单位财务管理，指导监督全县水利行业财务管理工作；研究提出预算管理、资金管理、政府采购管理、国有资产管理和非税收管理等制度、办法；负责全县水利行业的水利基建投入帐务处理及协助统计员做好各类水利综合情况统计工作；负责局机关和指导局直属单位财务状况、劳动工资、劳动保护及社会保险征缴等统计工作；负责组织全县水利行业财务人员继续教育培训工作。