我国两岸三地房地产税的征收方式不同，在房地产税基争议处理方面也完全不同。台湾的房地产税亦称“房捐”，香港的房地产税亦称“差饷”，澳门的房地产税亦称“房屋税”，因为历史原因，这三地的房地产在持有环节征税已经多年，房地产税基争议处理机构稳健、制度成熟。我国大陆地区房地产税基争议目前主要集中在交易环节，各省在房地产税基争议处理方面采用的方法不尽相同，对房地产税基争议研究也比较薄弱。究其原因，我国房地产税基争议主要有纳税方、登记方、评估方、征税方的原因，有的争议还涉及到法律和政策。

正因为原因复杂多样，房地产税基争议处理必然是一个系统性工程，需要一系列的制度来保障它的正常运行。制度体系建设必需坚持现实性、合理性、科学性、平等性和严肃性，对争议处理的咨询环节、解释环节、复核环节、行政复议环节、法院诉讼环节等都用制度进行详细而严格的限定，使房地产税基争议处理达到制度化、规范化，确保技术的刚性，使公平正义渗透至房地产税基争议处理的每一个关键性工作环节。在此基础上，提出房地产税基争议处理设置为四个层次。而与此相配套的机构也分为评估层面、征管层面、诉讼层面和专家鉴定层面的机构。