导读：① SSH技术需要较多的起始材料且更多地依赖于PCR技术，若是mRNA量不够，低丰度的差异表达基因cDNA可能检测不到 ② 消减库中的cDNA经过Rsal等限制酶消化后，不再是全长cDNA ③ 不能同时对多个材料之间进行比较,材料之间存在过多的差异及小片段缺失也不能有效被检测 ④完全无酶切位点的片段或酶切位点较少的基因组无法用SSH技术筛选 ⑤ 利用抑制消减杂交所获得的片段，须经过Nothern杂
① SSH技术需要较多的起始材料且更多地依赖于PCR技术，若是mRNA量不够，低丰度的差异表达基因cDNA可能检测不到
