根据上述职责，县财政局内设13个职能科室。

(一)办公室

负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作；负责机关人事党务工作、承担机关财务、国有资产、信息、综治、安全、保密、信访、政务公开等工作。

(二) 预算科

分析预测宏观经济形势并提出宏观调控政策建议；研究提出财政政策、财政体制、预算管理制度和中长期财政规划的建议；编制年度县本级决算草案和办理预算追加事宜；承担县本级部门预算审核、调整工作；承担县本级部门支出标准体系建设及项目库管理工作；承担县对乡（镇）转移支付工作，汇总年度全县财政预算。

(三)县国有资产管理办公室（副科级）

制定和监督执行政府公共财产管理制度，组织公共资源管理情况的综合调查，提供公共资源分布、结构及调整方案和加强管理的建议，承担全县国有资产的清查核资、产权界定，产权登记、调查统计等工作，对资产评估报告予以核准备案，参与县属国有企业的改制工作。

(四)综合计划科

研究提出有关的收入分配政策和改革方案；管理住房改革预算资金；会同有关方面拟订土地、矿产等国有资源收入政策，管理土地及矿产等国有资源收支；负责城市维护资金的财务管理，具体分管建口部门预算内外资金和专项资金；承担彩票管理的有关工作。

(五) 文教行政财务科

承担行政、政法、教育、文化、科技等方面的部门预算有关工作；拟订行政性经费的财务管理制度。承担义务教育经费保障机制改革的具体工作。

(六) 农业财务科（挂乡镇财政管理局牌子）

承担农业、林业、水利等方面的部门预算有关工作；拟订财政支农资金管理办法和有关行业事业、企业财务管理制度；管理支农专项资金，管理政策性农业和扶贫专项贷款贴息，统筹安排财政扶贫移民资金。指导全县乡镇财政工作。负责全县契税、耕地占用税的征收管理，参与财政涉农资金监管，组织财政补贴资金发放。

(七) 社会保障科

承担人力资源和社会保障、民政、卫生等方面的部门预算有关工作；会同有关方面管理全县财政社会保障和就业及医疗卫生支出；会同有关方面拟订有关资金（基金）财务管理制度，承担社保基金财政监管工作；编制社会保障预决算草案，审核全县社会保险基金预决算草案。

(八) 企业财务科

承担工业和信息、商贸、环保、安全生产等方面的部门预算有关工作；研究提出支持企业改革和发展的财政政策；承担国有资本经营预算的有关工作；组织实施企业财务管理的各项制度；按规定管理扶持企业发展资金、重大科技专项资金及环保专项等资金。

(九) 会计科

组织实施国家统一的会计准则制度、内部控制规范、注册会计师行业规章制度；管理会计从业资格；按规定承担会计专业技术资格管理工作；承担指导和监督注册会计师、会计师事务所业务的工作；组织实施会计信息化标准。

(十) 财政监督局

拟订财政监督检查的政策和制度；负责监督全县财政系统在预算编制和执行过程中执行财政法规、政策和制度的情况；承担监督检查会计信息质量和注册会计师行业执业质量的有关工作，依法查处违法违规行为；检查反映财政收支管理中的重大问题；提出加强财政管理的政策建议；监督检查局内及下属事业单位财务收支管理情况；指导全县财政监督业务工作。

(十一) 基本建设科

负责全县预算外基本建设项目资金的管理、拨付和监督，参与和评估立项项目，监督和参与兴建工程的预决算和招投标，拟订基本建设财务管理制度，参与本级年度基本建设投资计划安排和中长期投资计划，承担财政投资评审管理工作。

(十二) 县政府采购办公室

拟订政府采购的地方性法规规定草案，制定县本级政府采购目录和公开招标采购范围的限额标准，负责政府采购事务的协调管理、检查监督和投诉受理。

(十三) 行政审批服务科

负责本部门简易审批事项的审批、受理、协调部门内部对复杂审批事项和联合审批事项的办理和服务。

纪检组（监察室），为县纪委（县监察局）派驻机构。