学院加强学科建设，培育特色与优势学科，设有机械设计与理论、机械制造及自动化、控制理论与控制工程、电路与系统等二级学科及浙江省船舶先进制造技术研发中心和先进制造技术研究所等科研机构。其中机械设计与理论、控制理论与控制工程为校级重点学科。主要在船舶、港口、渔业、临港工业等专业相关的领域开展较高层次的科学研究和社会服务。从2006年到2009年近三年的时间里，承担省级重点科技攻关、省级自然科学基金、省新世纪教改、省级精品课程等科研和教学研究项目47项，发表学术论文100余篇，其中被三大检索收录20余篇，出版专著、教材多部。多名教授、学术骨干在省级、国家级学术机构中担任职务。
